Come la scienza aperta può aiutare i ricercatori a prepararsi per la prossima pandemia
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NVIDIA si è unita a Google DeepMind e all'European Bioinformatics Institute del Laboratorio Europeo di Biologia Molecolare per rilasciare un dataset aperto contenente strutture 3D predette di complessi proteici virali derivati da oltre 2.800 virus. Questa iniziativa mira a preparare gli scienziati alle future pandemie fornendo dati strutturali cruciali, indisponibili durante i focolai precedenti. Le previsioni sono state generate utilizzando AlphaFold2, ottimizzato con il NVIDIA BioNeMo Inference Runtime, consentendo una rapida scalabilità su migliaia di proteomi virali. Circa il 30% delle interazioni proteiche incluse è completamente nuovo alla scienza, offrendo intuizioni innovative per lo sviluppo di vaccini e farmaci. Rendendo questi dati liberamente accessibili tramite l'AlphaFold Database, i ricercatori possono evitare i metodi tradizionali di cristallizzazione, che richiedono molto tempo, e accelerare la generazione di ipotesi. La collaborazione prevede anche il rilascio del BioNeMo Structure Prediction Pipeline accelerato da GPU, affinché altri scienziati possano prevedere le strutture dei propri target. Questo sforzo sostiene la preparazione globale alle pandemie, aiutando in particolare le aree a risorse limitate e affrontando la stima di una probabilità del 50% che si verifichi una grave pandemia entro il 2050.
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