Как открытая наука может помочь исследователям подготовиться к следующей пандемии
nvidia ·
NVIDIA совместно с Google DeepMind и Европейским институтом биоинформатики Европейской лаборатории молекулярной биологии (EMBL-EBI) выпустила открытый набор данных, содержащий предсказанные трёхмерные структуры белковых комплексов вирусов более чем из 2800 видов. Эта инициатива направлена на подготовку учёных к будущим пандемиям за счёт предоставления критически важных структурных данных, которых не хватало во время предыдущих вспышек. Предсказания были получены с помощью AlphaFold2, оптимизированной с использованием NVIDIA BioNeMo Inference Runtime, что позволило быстро масштабировать вычисления для тысяч вирусных протеомов. Примерно 30% включённых белковых взаимодействий являются полностью новыми для науки, предлагая новые возможности для разработки вакцин и лекарств. Сделав эти данные свободно доступными через базу данных AlphaFold, исследователи могут избежать трудоёмких традиционных методов кристаллизации и ускорить генерацию гипотез. В рамках сотрудничества также публикуется ускоренный GPU конвейер предсказания структур BioNeMo Structure Prediction Pipeline, позволяющий другим учёным предсказывать структуры для их собственных целей. Эти усилия поддерживают глобальную готовность к пандемиям, особенно помогая регионам с ограниченными ресурсами, и учитывают оценочные 50% вероятности возникновения серьёзной пандемии к 2050 году.
nvidia