开放科学如何帮助研究人员为下一次大流行做好准备
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英伟达与谷歌DeepMind及欧洲分子生物学实验室欧洲生物信息学研究所合作,发布了一个包含来自2800多种病毒的病毒蛋白复合物预测三维结构的开放数据集。该举措旨在通过提供此前疫情爆发期间无法获取的关键结构数据,帮助科学家为未来大流行病做好准备。这些预测结果利用AlphaFold2生成,并通过英伟达BioNeMo推理运行时进行优化,从而能够针对数千个病毒蛋白质组快速扩展规模。其中约30%的蛋白质相互作用对科学界而言是完全全新的,为疫苗和药物开发提供了新见解。通过AlphaFold数据库免费开放这些数据,研究人员可以绕过耗时漫长的传统结晶方法,加速假设生成。此次合作还发布了基于GPU加速的BioNeMo结构预测管道,以便其他科学家能够对其自身目标进行结构预测。这一努力支持全球大流行病准备工作,尤其有助于资源匮乏地区,并应对到2050年发生严重大流行病的概率估计为50%的风险。
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