使用 RFD4-Proteina 和 Hugging Face Spaces 进行蛋白质设计
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英伟达与华盛顿大学联合开发了RFD4-Proteina,这是一款用于可编程蛋白质设计的BioNeMo开源模型,将序列和结构生成整合到单一工作流中。该系统通过结合流匹配模型与自编码器,减少了通常在独立模型交接过程中造成的信息丢失。用户可通过Hugging Face Spaces访问该工具,英伟达赞助了2026年10月21日至11月4日期间的免费GPU访问权限。该模型具备“思考设置”功能,允许进行不同级别的计算细化,从而显著提高了设计效率。详细的基准测试表明,高思考设置下每GPU小时的结构性独特设计数量远超竞争方法。文章提供了通过命令行、Python脚本或Diffusers库运行设计的全面指南,包括PD-L1结合蛋白生成的具体代码示例。此外,该平台包含SecureDNA生物安全筛查功能,在确保合规性的同时,允许用户参与外部蛋白质设计竞赛。
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